龍坑生態保護區全區都是隆起的珊瑚礁地形，旺盛的侵蝕作用，形 成處處崩崖、裙礁、峽谷等獨特的地形，仿如走進洪荒時代的侏儸 紀。在氣勢磅礡的環境中，有著種類繁多且深具研究價值的動植物 ，進入龍坑生態保護區必須先向墾丁國家公園管理處申請，每天以 200 人為原則。
龍坑生態保護區全區都是隆起的珊瑚礁地形，旺盛的侵蝕作用，形 成處處崩崖、裙礁、峽谷等獨特的地形，仿如走進洪荒時代的侏儸 紀。在氣勢磅礡的環境中，有著種類繁多且深具研究價值的動植物 ，進入龍坑生態保護區必須先向墾丁國家公園管理處申請，每天以 200 人為原則。 
由於海灣是波浪能量減低的地方，附近海域的貝殼、孔蟲、珊瑚長 期被海浪侵蝕、擊碎研磨成晶瑩明亮的細砂，隨海流飄洋過海堆積 於灣內；為極珍貴的「貝殼砂」，目前已列為生態保護區，並設立 貝殼砂展示館，展示館內有砂島上的砂讓遊客觀賞，也有顯微鏡讓 遊客觀察貝殼砂。
由南灣往鵝鑾鼻之間的海岸有一片茂密的熱帶森林，在船帆石到香 蕉灣共有 178 種熱帶林木，是目前台灣保持較為完整且碩果僅存的 海岸原生林。地形上屬於大型高位珊瑚礁岩，其中有多種台灣特有 的海岸植物景觀，在學術研究及觀賞上均具有極高價值，也有著名 的香蕉灣湧泉。此處也是浮潛勝地，珊瑚礁及熱帶魚群種類繁多。
社頂公園位於墾丁森林遊樂區的東南側，是墾丁國家公園內最完整 的珊瑚礁森林生態系，也是最具規模的石灰岩台地地形景觀區域。 園內風光明媚，包含了珊瑚地形、草原、石炭岩洞、灌木林、峽谷 ，公園內僅規劃簡單步道，以維持自然原貌。這裡可遠眺東海岸風 景，也是觀賞灰面鷲的最佳地點。
南仁山生態保護區為天然熱帶季風林雨林，是國內少數的低海拔原 始林。其間具備丘陵、山谷、沼潭、溪流、草原等多變地形，且因 不易抵達，仍保有完整的動植物生態，其間孕育著上千種植物與各 類野生動物，每年十月則有大批灰面鷲在此過境，景觀壯麗。完整 之動物相及珍貴之植群，是墾丁國家公園之精華所在。